Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChgaP26339 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChgaP26339 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChgaP26339 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChgaP26339 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 867.7 ms