Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms