Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myf5P24699 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms