Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms