Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clk1P22518 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clk1P22518 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clk1P22518 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms