Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim1P20664 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim1P20664 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim1P20664 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim1P20664 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prim1P20664 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prim1P20664 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prim1P20664 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim1P20664 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms