Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P20040 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P20040 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P20040 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P20040 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P20040 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P20040 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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