Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PdgfaP20033 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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