Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Esr1P19785 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Esr1P19785 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Esr1P19785 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms