Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtpraP18052 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpraP18052 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpraP18052 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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