Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PcnaP17918 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms