Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms