Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna3P16390 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna3P16390 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna3P16390 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms