Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SptbP15508 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SptbP15508 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SptbP15508 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SptbP15508 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SptbP15508 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SptbP15508 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SptbP15508 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SptbP15508 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SptbP15508 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SptbP15508 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SptbP15508 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SptbP15508 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SptbP15508 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SptbP15508 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SptbP15508 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SptbP15508 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SptbP15508 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SptbP15508 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SptbP15508 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SptbP15508 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SptbP15508 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SptbP15508 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SptbP15508 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SptbP15508 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SptbP15508 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SptbP15508 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SptbP15508 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SptbP15508 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SptbP15508 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms