Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Dnmt1P13864 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms