Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms