Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms