Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms