Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms