Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd8bP10300 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms