Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc9P09633 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms