Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col3a1P08121 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms