Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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