Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TnfP06804 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TnfP06804 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnfP06804 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnfP06804 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TnfP06804 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TnfP06804 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TnfP06804 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TnfP06804 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnfP06804 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TnfP06804 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TnfP06804 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TnfP06804 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TnfP06804 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms