Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-T23P06339 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-T23P06339 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms