Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06335 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06335 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06335 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06335 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06335 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06335 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06335 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06335 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06335 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06335 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06335 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06335 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06335 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms