Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-K1P01901 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-K1P01901 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms