Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01800 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01800 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01800 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01800 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01800 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01800 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01800 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01800 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01800 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01800 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01800 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01800 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01800 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms