Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01735 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01735 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01735 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01735 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01735 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01735 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01735 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01735 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
P01735 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01735 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01735 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01735 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01735 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms