Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01727 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01727 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01727 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01727 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01727 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01727 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01727 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01727 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01727 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01727 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01727 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms