Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01660 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01660 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01660 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01660 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01660 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01660 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P01660 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01660 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01660 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01660 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01660 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01660 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01660 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01660 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01660 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01660 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01660 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01660 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01660 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01660 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01660 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01660 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms