Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C4bP01029 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C4bP01029 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C4bP01029 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4bP01029 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4bP01029 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4bP01029 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4bP01029 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4bP01029 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4bP01029 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C4bP01029 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4bP01029 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4bP01029 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4bP01029 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4bP01029 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4bP01029 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4bP01029 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4bP01029 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4bP01029 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4bP01029 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4bP01029 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
C4bP01029 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4bP01029 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4bP01029 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4bP01029 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4bP01029 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4bP01029 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4bP01029 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4bP01029 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4bP01029 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4bP01029 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4bP01029 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4bP01029 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4bP01029 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4bP01029 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4bP01029 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4bP01029 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4bP01029 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4bP01029 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4bP01029 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4bP01029 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4bP01029 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms