Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms