Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
F11rO88792 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
F11rO88792 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
F11rO88792 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
F11rO88792 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
F11rO88792 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
F11rO88792 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F11rO88792 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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