Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1O88746 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1O88746 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1O88746 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tom1O88746 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1O88746 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1O88746 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms