Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfrO88507 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfrO88507 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfrO88507 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfrO88507 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms