Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme6O88425 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme6O88425 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme6O88425 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme6O88425 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme6O88425 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms