Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SfnO70456 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SfnO70456 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SfnO70456 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SfnO70456 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SfnO70456 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SfnO70456 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SfnO70456 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SfnO70456 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SfnO70456 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SfnO70456 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SfnO70456 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SfnO70456 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms