Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtssO70370 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtssO70370 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtssO70370 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtssO70370 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtssO70370 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtssO70370 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtssO70370 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtssO70370 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtssO70370 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtssO70370 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtssO70370 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtssO70370 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CtssO70370 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtssO70370 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtssO70370 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CtssO70370 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CtssO70370 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms