Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt5hO55201 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt5hO55201 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt5hO55201 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt5hO55201 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt5hO55201 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt5hO55201 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt5hO55201 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms