Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrxO55103 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrxO55103 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrxO55103 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrxO55103 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrxO55103 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrxO55103 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrxO55103 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrxO55103 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrxO55103 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PrxO55103 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrxO55103 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrxO55103 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrxO55103 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrxO55103 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrxO55103 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrxO55103 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrxO55103 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrxO55103 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrxO55103 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrxO55103 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrxO55103 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrxO55103 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrxO55103 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrxO55103 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrxO55103 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrxO55103 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrxO55103 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrxO55103 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrxO55103 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrxO55103 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrxO55103 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrxO55103 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrxO55103 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PrxO55103 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrxO55103 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrxO55103 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrxO55103 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrxO55103 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrxO55103 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PrxO55103 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrxO55103 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrxO55103 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrxO55103 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrxO55103 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrxO55103 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrxO55103 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrxO55103 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrxO55103 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PrxO55103 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PrxO55103 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrxO55103 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrxO55103 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrxO55103 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrxO55103 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrxO55103 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrxO55103 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrxO55103 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrxO55103 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrxO55103 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrxO55103 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrxO55103 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PrxO55103 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PrxO55103 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrxO55103 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrxO55103 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrxO55103 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrxO55103 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PrxO55103 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrxO55103 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrxO55103 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms