Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6bO54951 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms