Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms