Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp10aO54827 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms