Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffbO54788 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffbO54788 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffbO54788 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DffbO54788 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffbO54788 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffbO54788 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms