Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms