Protein–RNA interactions for Protein: O35668

Hap1, Huntingtin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hap1O35668 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hap1O35668 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hap1O35668 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hap1O35668 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hap1O35668 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hap1O35668 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hap1O35668 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms