Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms