Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TnxbO35452 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TnxbO35452 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TnxbO35452 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TnxbO35452 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TnxbO35452 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TnxbO35452 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
TnxbO35452 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TnxbO35452 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TnxbO35452 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TnxbO35452 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TnxbO35452 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TnxbO35452 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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