Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms